幼年及壮年树冠圆锥形，老则广卵形；枝近轮生，斜上伸展（雌株的大枝常较雄株开展）；一年生的长枝淡褐黄色，二年生以上变为灰色，并有细纵裂纹；短枝密被叶痕，黑灰色，短枝上亦可长出长枝；冬芽黄褐色，常为卵圆形，先端钝尖。

叶互生，在长枝上辐射状散生，在短枝上3~5枚成簇生状，有细长的叶柄，扇形，两面淡绿色，无毛，有多数叉状并列细脉，在宽阔的顶缘多少具缺刻或2裂，宽5~8（~15）厘米，具多数叉状并歹帕细脉。在长枝上散生，在短枝上簇生。它的叶脉形式为“二歧状分叉叶脉”。[1] 在长枝上常2裂，基部宽楔形，柄长3-10（多为5~8）厘米，幼树及萌生枝上的叶常较而深裂（叶片长达13厘米，宽15厘米），有时裂片再分裂（这与较原始的化石种类之叶相似），叶在一年生长枝上螺旋状散生，在短枝上3~8叶呈簇生状，秋季落叶前变为黄色。

球花雌雄异株，单性，生于短枝顶端的鳞片状叶的腋内，呈簇生状。雄球花葇荑花序状，下垂，雄蕊排列疏松，具短梗，花药常2个，长椭圆形，药室纵裂，药隔不发；雌球花具长梗，梗端常分两叉，稀3-5叉或不分叉，每叉顶生一盘状珠座，胚珠着生其上，通常仅一个叉端的胚珠发育成种子，内媒传粉。它的雄花花粉萌发时仅产生两个有纤毛会游动的精子。

4月开花，10月成熟，种子具长梗，下垂，常为椭圆形、长倒卵形、卵圆形或近圆球形，长2.5~3.5厘米，径为2厘米，假种皮骨质，白色，常具2（稀3）纵棱；内种皮膜质。种皮肉质，被白粉，外种皮肉质，熟时黄色或橙黄色，外被白粉，有臭叶；中处皮白色，骨质，具2~3条纵脊；内种皮膜质，淡红褐色；胚乳肉质，味甘略苦；子叶2枚，稀3枚，发芽时不出土，初生叶2~5片，宽条形，长约5毫米，宽约2毫米，先端微凹，第4或第5片起之后生叶扇形，先端具一深裂及不规则的波状缺刻，叶柄长0.9~2.5厘米；有主根。

银杏树为裸子植物中唯一的中型宽叶落叶乔木，可以长到25－40米高，胸径可达4米，幼树的树皮比较平滑，呈浅灰色，大树树皮呈灰褐色，表面有不规则纵裂，有长枝与生长缓慢的锯状短枝。有着较为消瘦的树冠，枝杈有些不规则。一年生枝为淡褐黄色，二年生枝粗短，暗灰色，有细纵裂纹。冬芽为黄褐色，多为卵圆形，先端钝尖。

银杏叶子在种子植物中很特别，是裸子植物中唯一一种阔叶落叶乔木，叶子是扇形，呈二分裂或全缘，叶脉和叶子平行，无中脉。在一年生枝上，叶螺旋状散生，在短枝上3至8片叶呈簇生状。

成年银杏的扇形叶片主要有全缘、二分裂或多裂形态，但银杏幼株的叶片多数为二分裂，间中是多裂，极少是不裂的。

雄球花4至6枚，花药黄绿色，花粉球形。萌发时产生具两个纤毛的游动精子。雌球花有长梗，梗端分为二叉，少有3至5叉或不分叉。

银杏具有一定观赏价值。因其枝条平直，树冠呈较规整的圆锥形，大量种植的银杏林在视觉效果上具有整体美感。银杏叶在秋季会变成金黄色，在秋季低角度阳光的照射下比较美观，常被摄影者用作背景。

银杏为裸子植物，只有种子的构造，尚未演化出被子植物的果实，但银杏种子的种皮发达，看起来与被子植物的果实相似。银杏种子是1.5-2厘米，包在2-3厘米的棕黄色的种皮里。银杏的种子称为白果，有点像杏子，因为含有很多丁酸，闻起来象是腐败的奶油。也有人对果浆中的成分过敏，发痒长水泡，洗果子的时候需要戴手套。种子剥出烧熟可以吃，是中国和日本的传统食物。

和它相亲的银杏类植物在两亿七千万年前的二叠纪时就已经生成，属于银杏门。晚三叠纪时，银杏类植物快速发展，之后的侏罗纪和早白垩纪达到了鼎盛时期，银杏类的五个科同时存在，除赤道外广泛分布于世界各大洲。但白垩纪后期被子植物迅速崛起时，银杏类像其它裸子植物一样也急剧衰落。晚白垩纪后除个别发现外，银杏科以外的银杏类植物已基本绝迹。晚白垩纪和古近纪，银杏（主要为银杏属Ginkgo 和似银杏属Ginkgoites）在欧亚大陆和北美高纬度地区呈环北极分布，渐新世时由于寒冷气候不断向南迁徙，并在此之后不断衰落。

银杏在中新世末在北美消失，上新世晚期在欧洲消失。250多万年前发生第四纪冰河时期，令银杏数量继续减少，面临绝灭的危机，而中国南部因地理位置适合和气候温和，成为银杏的最后栖息地。中国的银杏大化石纪录始于始新世；日本直至上新世，甚至更新世早期都有银杏叶化石发现，但没有发现繁殖器官。而现在的银杏是这个门的植物中生存至今的唯一成员，因此又被称为“活化石（孑遗植物）”。

中国人种植银杏历史悠久，在邳州发现一棵千年古银杏，千年银杏树植于北魏正光年间，已有近1500年的历史，被称为徐州最古老的银杏树。因为佛教认为银杏是圣树，所以僧侣们在庙里的栽种，而且养护上千年。